יש לבחור את החומרים המתכלים הנדרשים לחדרים נקיים על פי רמת הניקיון ותרחיש השימוש שלהם (למשל, ייצור אלקטרוניקה, ביו-רפואה, עיבוד מזון וכו').
1. ציוד מגן לחדר נקי: חליפות לחדר נקי, כפפות לחדר נקי (ניטריל, לטקס, PVC), מסכות לחדר נקי, נעלי חדר נקי/כיסויי נעליים, רצועות יד/רצועות קרסול אנטי-סטטיות. חומרים מתכלים אלה חייבים לעמוד בדרישות אנטי-סטטיות וללא מוך-.
2. ציוד ניגוב לחדר נקי: מגבונים לחדר נקי (מיקרופייבר, פוליאסטר), נייר לחדר נקי, מגבונים לחדר נקי. מתאים לניגוב אבק וכתמים על משטחי ציוד ומשטחי מוצר, מניעת שאריות חלקיקים.
3. אריזה וציוד לחדר נקי: שקיות אריזה לחדר נקי (שקיות PE, אנטי- מיגון סטטי), קופסאות/מגשים לחדר נקי, אריזות שלפוחיות אנטי-סטטיות. משמש לאחסון והובלת מוצרים בתוך סביבות נקיות.
4. ציוד מעבדה וייצור לחדר נקי: קצות פיפטות סטריליות חד פעמיות, שפופרות צנטריפוגות סטריליות, מזרקים סטריליים, ממברנות סינון לחדר נקי, סרט חדר נקי אנטי-סטטי. חומרים מתכלים אלה נמצאים בשימוש תדיר בחדרי תרופות ביו-פרמצבטיים או במעבדה.
5. חומרי עזר אחרים: מחצלות דבק ספציפיות ל-חדר נקי (להסרת אבק מסוליות הנעליים), מטליות ללא מוך- וחומרי ניקוי אנטי-סטטיים.

